随着生物医药技术以及计算机科学技术的发展,质谱分析技术在蛋白质组学及糖组学等多领域得到了应用,包括蛋白质鉴定、寡糖结构鉴定、生物标记物发现与疾病诊断建模等。质谱检测技术主要分为两大类dda技术(datadependentacqui-sition数据依赖采集模式),dia (data independent acquisition,数据非依赖采集),具体分析方法可细分为库搜索方法和denovo方法。理论谱预测作为基于质谱分析鉴定方法设计中的一个重要的环节,对于库搜索方法及denovo方法的鉴定准确性都有很大的影响。然而大部分蛋白质鉴定软件在理论谱预测环节的设计太粗糙,从而影响了最终鉴定结果的准确性。理论谱预测是指设计算法模型模拟蛋白质序列在质谱仪中碎裂的方式,从而构建一个理论的质谱用于跟实际质谱数据进行比较。
样章
书籍预览文件:
内容:
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扉页
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作者简介
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摘要
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目录
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第一章
引言
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第二章
质谱分析算法综述
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第三章
基于质子迁移模型的理论谱预测算法
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第四章
基于词条库的理论谱预测算法
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第五章
基于词条库的理论谱预测算法
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第六章
基于dia质谱分析的糖蛋白鉴定算法
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第七章
结束语
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参考文献
读者人群:
对蛋白质组学及糖组学数据质谱解析感兴趣的学者
王耀君,中国农业大学信息与电气工程学院教师,研究生导师,中国农业大学青年科学家创新团队成员。研究方向为:机器学习、生物信息。博士毕业于中国科学院计算技术研究所,现担任中国人工智能协会生物信息学与人工生命专委会委员、河南省大数据专家委员会成员、北京软件交易所评审专家等。担任journal of healthcare engineering、ieee icbda等期刊及会议审稿人。发表科研论文30余篇,软件著作权10余项。